紫鑫药业基因测序仪多领域应用启动 挖掘数据金矿
- 发布时间:2015-08-11 00:31:22 来源:中国证券报 责任编辑:张恒
8月7日,紫鑫药业所属的中科紫鑫举行BIGIS二代测序仪系统推介会,并与中国检验检疫研究院、北京大学人民医院、北京出入境检验检疫局等单位签订了试用协议。此举标志着中国第一款具有自主知识产权的实用型国产测序仪开始了多领域的测序应用,填补了我国在基因测序产业链上游设备制造领域的一项空白。
中科院北京基因组研究所专家、中科紫鑫基因测序项目负责人任鲁风对中国证券报记者表示,基因测序是精准医学的基础,具有巨大商业前景。中科紫鑫BIGIS系统争取在2016年投入批量生产。
精准医学的基础
基因是生命现象的原代码。通过基因来认识生命现象,已成为当今生物学、医学等领域一项重要研究任务。
近年来,随着测序技术与产品的迅速迭代更新,基因测序成本急剧下降,精准医疗开始走进普通百姓的生活。2015年,世界各国纷纷开启精准医学计划,也被称为基因测序临床应用的元年。
任鲁风表示,精准医学的推广将极大地促进基因测序系统建设及应用的发展;同时,基因测序在农业、食品检验检疫、生物研究等领域的广泛应用,将开启一个巨大的商业市场。
根据Markets & Markets的一项研究报告,2014年二代基因测序的全球市场规模为25亿美元,预计2020年将达到87亿美元,复合增长率23%。其中,二代基因测序是基因学领域中增长最快的子行业,超过基因芯片和PCR技术。
基因测序是精准医学的基础,应用领域广泛,涉及到人民群众的生命健康,又具有巨大的商业前景。
争取25%市场份额
据任鲁风介绍,中科院基因组所从2008年开始研发基因测序仪,在紫鑫药业的支持下,2014年4月BIGIS基因测序仪产品样机在长春正式发布,并开始征集用户试用。
BIGIS基因测序仪,最初由中科院基因组所和半导体所参与开发,是整合了一系列机电控制、微流体、光学和软件控制系统的高度集成的新一代测序平台。迄今中科紫鑫已申请专利40多项,另外还有200多项在申请和准备申请,目前可以提供全套的基因测序解决方案,包括全基因组测序,尤其是细菌、病毒等微生物基因组,靶向区域重测序、数字表达谱分析等。
任鲁风说,BIGIS系统的测序通量为5-400Mb,可以满足除全基因组测序外的大部分测序应用;500-1000bp的读长能够有效提高拼接、比对检测的准确性,并降低分析计算压力,测序准确性达到99.995%。但设备价格低于进口设备的1/3以上,应用成本低于进口设备的1/5以上。作为中国第一款自主知识产权的测序仪,BIGIS基因测序仪更加接“地气”、更加符合国家生物信息安全的要求。
任鲁风称,样机发布后,用了半年时间进一步的完善,进行了适应性测试、试剂配合测试、工程化测试等产业化之前的一系列准备。2014年底开始小试生产,目前已生产了23台样机,并从90多家报名试用的客户中遴选了18家,涉及医学、检验检疫、中药药材研究、海洋生物研究等多个领域。虽然试用进程略晚于预期,但基础更加坚实。目前BIGIS系统的技术指标已经达到并部分超越国际主流设备,计划开展试用工作后,每两个月召开一次用户大会,进行学术和经验交流,开始研制上市机型并做好生产准备工作。争取在2016年初投入批量生产。
对于基因测序仪的市场预期、产能和产品销售情况,任鲁风表示,基因测序正在向多个领域渗透,具有巨大的市场潜力。随着技术进步和产业化的进展,今年年初我们调增2018年的市场需求至20万台,并有信心拿到四分之一的市场份额。
关于市场担心产品升级替代问题,任鲁风说,目前第三代测序设备因准确率不高,还需用二代测序仪进行纠错。BIGIS所采用的第二代基因检测技术仍是现今最稳定、应用最广泛的基因测序技术。另外,中科紫鑫和有关方面合作已经在研究二代终结技术,将采用全新的技术原理,全面提升第二代相关设备在通量、准确性、成本等指标。
任鲁风表示,近期公司在医疗机构中走的还是科研通道而非临床诊断,不需要CFDA的认证,医院等相关科研机构的科研通道市场也非常庞大。但是我们也在为申报CFDA做相关准备,面向临床诊断市场。
挖掘数据金矿
精准医学是基因测序的重要应用方向之一。任鲁风表示,根据大量数据积累和分析得到数据库,找到不同的基因类型和疾病与用药之间的关系,之后通过个体不同的基因或基因表达水平的不同,与数据库对照,可以发现每个人每种疾病的预防、发生、发展、治疗、预后均和基因具有显著的相关性。针对不同个体采取有针对性的治疗方法,就是精准医学。
精准医学以测序为基点,但相关数据库的建设还刚刚开始,基因数据缺失是影响精准医学发展的重要障碍。
任鲁风说,除了部署在终端实验室的样品制备、文库构建和序列测定的检测系统之外,中科紫鑫计划建设统一的数据平台,通过云计算中心的形式,为用户提供后续的远程数据分析、解读和存储功能。通过测序终端和远程数据分析的有机集成,实现测序和数据分析的闭环整合。一方面为用户提供数据存储、数据分析等技术支持,增加了测序的易操作性和数据的安全性,另一方面将获得大量的数据,进行数据挖掘,与公司用户实现数据共享,进一步推动测序行业的发展。数据挖掘是一个巨大的金矿,未来3年,我们有望获得1亿人的基因数据,蕴藏着巨大的商业机会。公司将在测序仪软硬件的优化、大数据的存储和挖掘开发等方面,与国际顶级信息技术公司进行合作。
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