大黄鱼全基因组精细图谱绘制完成
- 发布时间：2015-05-04 03:35:50 来源：科技日报 责任编辑：罗伯特
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科技日报讯 （李来）4月2日，国家海洋局第三海洋研究所、浙江大学、深圳华大基因研究院、青岛海洋大学和深圳大学联合完成了大黄鱼全基因组测序，并绘制出大黄鱼基因组精细图谱。研究揭示了大黄鱼对环境胁迫应答的分子机制，为抗逆性的遗传改良提供了重要资源。该成果在线发表于国际著名学术期刊《美国公共科学图书馆——遗传学》。
大黄鱼是中国和东亚国家最具经济价值的海洋鱼类之一。其具有特殊的行为和生理特性，对于低氧和空气暴露等环境胁迫极为敏感。这些特性使大黄鱼成为研究环境胁迫应答机制的良好模型。为了探索大黄鱼对环境胁迫应答的分子和遗传机制，研究人员采用BAC组装策略与全基因组鸟枪法相结合的方法，克服了大黄鱼基因组的高杂合特性，对大黄鱼全基因组进行了测序，并获得了大黄鱼基因组精细图谱。组装的大黄鱼基因组大小为679 Mb，包含25401个蛋白编码基因。
此外，研究人员还对大黄鱼进行了脑部低氧转录组和皮肤粘液蛋白质组的研究。研究揭示了神经—内分泌—免疫/代谢新的调控网络在大黄鱼脑应答低氧胁迫中起到了关键的作用。他们还发现暴露在空气中的皮肤黏液含有3209种基因编码的蛋白，这是目前在鱼类黏液研究中发现最多的，这些蛋白的主要功能抗氧化、氧气运输等，揭示了皮肤黏液蛋白在大黄鱼应对空气暴露胁迫中的多重保护功能。
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